Сериал «Первый отдел» — это история о следователе, который пытается собрать свою жизнь по кусочкам. Брагин думал, что худшее позади после того, как с его жены сняли обвинения. Но прошлое не отпускает, ведь настоящий преступник так и не пойман, и эта неразрешенная история постоянно напоминает о себе.
Вернувшись на службу, Брагин обнаруживает, что его прежней должности больше нет. Его направляют в тихий районный архив, где нужно разбирать давно забытые дела. Среди пыльных папок он натыкается на странный факт — его предшественник не уволился, а бесследно исчез, и это никого особо не взволновало.
Постепенно работа с архивом перестает быть скучной обязанностью. Брагин начинает видеть связь между исчезновением коллеги и одним из старых, нераскрытых дел. То, что начиналось как бумажная рутина, неожиданно затягивает его в водоворот событий, где тайны прошлого оказываются ключом к очень опасному настоящему.